A história de Tokyo Ghoul segue Ken Kaneki, que mal sobrevive um encontro mortal com Rize Kamishiro, uma mulher que se revela ser um Ghoul, uma criatura semelhante à humana que caça e devora carne humana, e é levado para o hospital em estado crítico. Depois de se recuperar, Kaneki descobre que de alguma forma ele foi submetido a uma cirurgia que o transformou em um meio-Ghoul, e, assim como eles, deve consumir carne humana para sobreviver bem. Com ninguém mais a quem recorrer, ele é levado por os sarcófagos que gerenciam o café "Anteiku", que lhe ensinam a lidar com sua nova vida como um meio-humano / meio-Ghoul, inclusive interagindo com a sociedade Ghoul e sua conflitantes facções, enquanto se esforça para manter sua identidade secreta de outros seres humanos.